刚果红染色法特指用刚果红将纤维素染色的方法。刚果红能与培养基中的纤维素形成红色复合物，常用的刚果红染色法有两种。在刚果红中加入氯化钠可以可以使结合不牢的刚果红洗去。

刚果红的原理：

刚果红筛选主要是根据菌落降解纤维素,可以形成降解圈,氯化钠冲洗再烘干后可以让降解圈看的更清楚,更易观察、它可以与像纤维素这样的多糖物质形成红色复合物,但并不和水解后的纤维二糖和葡萄糖发生这种反应.在含有纤维素的培养基中加入刚果红染色后,再Nacl用漂洗,Nacl可以使结合不牢的刚果红洗去,这样就留下大大小小的透明圈。

刚果红染色法的使用：

方法一,先培养微生物，再加入刚果红进行焰色反应

在长出菌落的培养基上，覆盖质量浓度为1 mg/mI的CR溶液，10～15 min后，倒去CR溶液，加入物质的量浓度为l mol/l的NaCI溶液，15 min后倒掉NaCl溶液，此时，产生纤维素酶的菌落周围将会出现透明圈。

（加NaCl的原因：刚果红是结合到培养基的多糖底物，但分解纤维素的细菌可以产纤维素酶，能分解这个多糖底物成为寡糖，这样刚果红就不能结合上去了，氯化钠就可以使结合不牢的刚果红洗去，这样就留下大小不一的透明圈，大的透明圈分解纤维素的能力就强）。

方法二，在倒平板时就加入刚果红

配制质量浓度为10 mg/mI的CR溶液，灭菌后，按照每200 mI培养基加入1 mICR溶液的比例，混匀后倒平板。等培养基上长出茵落后，产生纤维素酶的菌落周围将会出现明显的透明圈。