（1）含有酸碱指示剂的培养基，若颜色不正确，通常是由于pH不正确导致的，加热过度、错误的灭菌方式等都会导致此项问题。
（2）加热过度导致某些成分分解或糖焦化，如SC培养基(SC增菌液)加热过度会变红，含糖量高的培养基，加热过度通常会出现颜色加深，呈焦糖色或棕褐色。
（3）某些成分变质，如血液久置易变黑，制成的平板颜色偏棕黑色。

（1）某些培养基原本就含有不溶性沉淀，如TTB，MC培养基等，配方中含有大量不溶性碳酸钙。
（2）灭菌前未充分溶解，如Fraser培养基中含有大量磷酸盐，若灭菌前溶解不充足，灭菌后就会出现大量沉淀。
（3）pH不正确，偏酸或偏碱都有可能使培养基中的部分金属离子产生沉淀。
（4）水的纯度不够，天然水中含有较多的矿物盐离子，若未除净，则易与培养基中的磷酸盐反应生成沉淀。
（5）添加剂加入温度不正确，卵黄、血液等对温度敏感的添加成分，若加入时温度过高或温差过大，易出现凝块。
（6）称量错误。
（7）试剂加入顺序不正确。

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